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Module doctoral 

Introduction à la modélisation structure-fonction des plantes

Objectifs
Sensibiliser des doctorants en biologie végétale ou en mathématiques appliquées à la biologie à la démarche intégrative et pluri-disciplinaire de la modélisation structure-fonction des plantes. 

Le module vise à initier des doctorants à la démarche d’observation, de mesure, d’analyse et de simulation d’une architecture végétale en y intégrant des fonctions physiologiques de base, et en illustrant quelques applications. Cette approche biologique sera enrichie par une sensibilisation à la modélisation du système complexe plante. 
Compétences visées
Connaissances sur 
  • les concepts de l’analyse architecturale des plantes
  • sur sa mise en œuvre pratique
  • sur la démarche de modélisation à mettre en place en simulation de systèmes complexes.

Les doctorants prendront connaissances des formalismes et outils spécifiques dédiés à la mesure, à l’analyse et à la simulation des plantes (digitalisation, T-Lidar, analyse statistique exploratoire, simulation numérique et validation par analyse de sensibilité). 
Module proposé par
Programme
  • Introduction à la démarche FSPM et aux concepts d’architecture des plantes
  • Formalismes de représentation et méthodes d’acquisition de l’architecture
  • Reconstruction 3D et exploration des structures
  • Panorama des fonctions et des modèles disponibles
  • Introduction aux méthodes de simulation
  • Exploration des simulations et analyses de sensibilité, exemple pour la recherche d’idéotypes pariétaux.
Des exemples concrets seront présentés par des conférences introductives et/ou d’ouverture, et mis en œuvre dans des TP-TD tutorés. Une séance de mesure sur le terrain sera également organisée.
Modalités d'inscription
L'inscription au module est gratuite (les frais de transport, hébergement et repas sont à la charge des unités de recherche dont dépendent les doctorants). 

Pour vous inscrire : 
Compléter le formulaire d'inscription et le renvoyer à Evelyne Costes.
Contact
Evelyne Costes, chercheur INRA, 
Responsable de l'équipe Architecture et fonctionnement des espèces fruitières (AFEF)
UMR 1334 Amélioration génétique et adaptation des plantes (AGAP)

Christophe Pradal, chercheur CIRAD, 
Équipe Modèles et méthodes pour le phénotypage des plantes (M2P2)
UMR 1334 Amélioration génétique et adaptation des plantes (AGAP) 
Informations pratiques
Organisation
30h sur une semaine
à Montpellier SupAgro

Dates  
Du lundi 12 mars 2018 - 14h
au vendredi 16 mars 2018 - 16h
Publics
Doctorants des grandes écoles en agronomique ou des filières universitaires scientifiques en biologie végétale (en particulier les doctorants inscrits dans les ED GAIA et I2S)
Ce module bénéficie d’un soutien d’Agreenium dans le cadre de son appel à projet « modules doctoraux 2017 ».